La producción agrícola actual enfrenta problemas de contaminación ambiental que se han solucionado parcialmente con sistemas de producción orgánica y el uso de agentes de biocontrol. El estudio de las interacciones planta-microbioma es un nuevo enfoque que permite detectar y usar las asociaciones benéficas de los microorganismos en la producción agrícola y con ello optimizar el uso de los recursos y mejorar la calidad poscosecha de la producción.