Las Facultades de Química e Ingeniería, a través de la Rectoría de la Universidad Autónoma de Querétaro (UAQ) y de la generación de recursos propios, cuentan con recursos financieros para hacer viable los posgrados y licenciaturas. En el rubro de becas para alumnos existen programas vigentes de becas de apoyo para reinscripciones, PRONABES (http://www.uaq.mx/index.php/novedades/438-becasapoyo) FOPER (http://www.uaq.mx/secretariadelarectoria/FOPER2013/de) además de proyectos internos FOFI y externos donde también existe recurso para becas.